基于生物信息学筛选糖尿病视网膜病变进展中的关键

摘要

目的：通过生物信息学分析的方法，筛选糖尿病视网膜病变（Diabetic retinopathy，DR）中的关键基因，探索新的治疗靶点。方法：通过 GEO 数据库检索 DR 相关的 mRNA 芯片数据，利用 R 包分析差异表达基因（DEG），然后进行富集分析以及构建蛋白质 - 蛋白质相互作用网络。结果：共筛选得到了 415 个 DEG，包括上调基因 21 个，下调基因 394 个。PPI网络分析得到包含 402 个节点和 146 条连线的网络图。利用 Cytoscape 软件可以筛选得到 RHO、GNAT1、RDH10、PDE6B、GNAT2、PDE6A、PDE6G、TYR、GNGT1、RGS9BP 这 10 个核心基因。结论：获得 DR 的差异表达基因、核心基因及 PPI 网络图，将为 DR 的治疗提供潜在的靶点。